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  • 杂志名称:现代医药卫生杂志
  • 主管单位:重庆市卫生局
  • 主办单位:重庆市卫生信息中心
  • 国际刊号:1009-5519
  • 国内刊号:50-1129/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 知网收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏
现代医药卫生杂志2015年第07期

华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白基因的生物信息学分析

周晨慧;徐道华;汪肖云;陈文君;李珊

关键词:华支睾吸虫病, 硫氧还蛋白质类, 膜蛋白质类, 基因, 计算生物学
摘要:目的:对华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白(CsTMX)基因进行生物信息学分析。方法利用生物信息学方法(InterProScan、SignalP、TMHMM和SWISS—MODEL等相关软件)对CsTMX基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、亲水性/疏水性、三级结构进行预测分析。结果 CsTMX基因的开放阅读框(ORF)包含414 bp,编码137个氨基酸,理论分子质量为16.04×103,等电点为5.16。TMHMM和SignalP3.0分析结果显示CsTMX含信号肽,其在第19~20位氨基酸之间有1个切割位点;InterProScan和SWISS—MODEL分析结果显示,TMX特征性结构域位于第21~27位氨基酸之间,并且具有高度保守的CPAC基因序列。结论利用生物信息学知识和各种分析软件对CsTMX所编码的cDNA序列及理论蛋白质的理化性质、结构和功能域等进行预测和分析,能够为开展CsTMX的表达及其功能研究提供理论依据。